Aegean Airlines ist eine griechische Fluggesellschaft mit Sitz in Athen.
Die Fluggesellschaft wurde 1987 als Aegean Aviation gegründet. Anfangs wurden nur Geschäftsflüge mit kleinen Privatjets durchgeführt. Im März 1999 wurde die heutige Aegean Airlines gegründet, die im Mai desselben Jahres mit zwei Avro RJ100 die ersten Passagierflüge durchführte. Im gleichen Jahr schloss man sich mit der Air Greece zusammen.
Im Jahr 2007 wurden insgesamt 5.226.163 Passagiere befördert, davon 3.355.962 innerhalb Griechenlands und 1.870.201 auf internationalen Flügen.
Die Fluggesellschaft bietet elektronische Tickets und ein Vielfliegerprogramm an.